As perturbações gastrointestinais podem levar a alterações nas fezes, incluindo alterações nos hábitos e propriedades das fezes, tais como alterações na frequência dos movimentos intestinais, que podem aumentar para 2-3 vezes por dia de 1-2 vezes por dia, ou mesmo diminuir para 2-3 vezes por dia. Também pode haver uma mudança na natureza das fezes, por exemplo, se as fezes foram previamente formadas, podem ficar sem forma, ou alguns pacientes podem ter fezes aquosas ou piegas, e pode haver muco. Nas perturbações gastrointestinais funcionais, não há sangue nas fezes, nem perda de peso, mas pode haver dor abdominal. Muitos doentes podem sentir dor abdominal como resultado de irritação alimentar depois de comer, o que pode levar a perturbações gastrointestinais e depois a mudanças nos hábitos e comportamento das fezes. Se esta for uma ocorrência frequente, recomenda-se que o paciente seja submetido a uma colonoscopia para determinar se a patologia é orgânica ou funcional.