Diz-se a um número muito pequeno de pacientes com epilepsia secundária que têm um raro tumor intracraniano chamado malformação hipotalâmica, e que os médicos explicarão em pormenor o diagnóstico e tratamento desta doença às suas famílias. Não é um tumor real, cresce lentamente à medida que o corpo se desenvolve e pára de crescer após um certo ponto, e raramente se torna maligno. Os tumores de malformação intracraniana mais comuns são os que ocorrem no hipotálamo (retratado) e são mais frequentemente diagnosticados pelo início da epilepsia, depois pela imagiologia e eventualmente pela patologia. Devido às suas características de tecido e crescimento, o perigo das malformações hipotalâmicas em si não afecta necessariamente a esperança de vida, mas a epilepsia que causam causa dores insuportáveis e por vezes fatais ao paciente, pelo que o tecido deve ser removido para controlar as convulsões, mas é claro que, por ser uma operação ao hipotálamo, é arriscada e difícil e deve ser tratada cirurgicamente por um médico experiente para se conseguir uma boa Os resultados.