Embora a maioria dos teratomas sejam tumores benignos, podem ser muito prejudiciais para o corpo da mulher e a melhor forma de os tratar é através de cirurgia. O procedimento depende do tipo de cirurgia escolhido e existem diferentes métodos de operação, desde a cirurgia aberta tradicional até à cirurgia histeroscópica minimamente invasiva. O melhor procedimento cirúrgico para os teratomas nesta fase é o laparoscópico, mas é muito exigente do ponto de vista técnico e, se o teratoma se romper durante o desbridamento microscópico, existe o risco de implantação peritoneal e de peritonite química. Na maioria dos casos, o tecido ovárico normal do lado afetado e o ovário oposto podem ser preservados ou não removidos se não for observada qualquer anomalia na ecografia pré-operatória e na exploração intra-operatória. O procedimento cirúrgico para o teratoma envolve normalmente o desbridamento completo da lesão, uma vez que a fronteira entre o teratoma e o tecido normal é relativamente clara. A cirurgia tradicional é menos utilizada, principalmente porque é mais invasiva e a recuperação é mais lenta e mais dolorosa para o doente, pelo que a maioria dos doentes opta pela cirurgia minimamente invasiva para a remoção. Após a cirurgia ao teratoma, o doente tem de ser revisto regularmente, uma vez que os teratomas são classificados como malignos ou benignos, enquanto os benignos não recorrem após a remoção, os malignos são propensos a recorrência e a metástases sistémicas.