A natureza das dores de cabeça de baixa pressão craniana é principalmente ligeira a moderada dor baça ou palpitante, frequentemente acompanhada de náuseas, vómitos, zumbido e visão turva.
Em primeiro lugar, está relacionada com a posição do corpo. Na posição vertical, há uma maior tracção nos nervos sensoriais e veias de ponte, e a dor é exacerbada pela tracção.
Em segundo lugar, está relacionada com a dilatação venosa. Como a compressão das veias jugulares aumenta a gravidade da dor de cabeça, a diástole venosa é um factor que contribui para a dor de cabeça.
Acredita-se também que a dor de cabeça da síndrome da pressão hipocraniana está relacionada com uma diminuição do volume e volume do líquido cefalorraquidiano. Quando traumas ou operações como a anestesia lombar causam uma perda de líquido cefalorraquidiano, a dor de cabeça manifesta-se frequentemente como um aumento da dor de cabeça.