A natureza da dor de cabeça de baixa pressão craniana é principalmente ligeira a moderada dor baça ou palpitante, frequentemente acompanhada de náuseas, vómitos, zumbido, e visão turva.
Em primeiro lugar, está relacionada com a posição corporal. Na posição vertical, a tracção do nervo sensorial e da veia de transição é aumentada, e a dor é intensificada após a tracção.
Em segundo lugar, está relacionada com a diástole venosa. Uma vez que a compressão da veia jugular aumenta a gravidade da dor de cabeça, a diástole venosa é um factor que contribui para a dor de cabeça.
Acredita-se também que a dor de cabeça da síndrome da pressão hipocraniana está relacionada com uma diminuição do volume e volume do líquido cefalorraquidiano. Quando traumas ou operações como a anestesia lombar causam perda de líquido cefalorraquidiano, há frequentemente uma manifestação de aumento da dor de cabeça.