Para a classificação das doenças cardíacas congénitas, classificamos frequentemente as doenças cardíacas congénitas em três categorias principais, com base na localização da malformação, se existe um shunt directo entre a cavidade cardíaca direita e a cavidade cardíaca esquerda e os grandes vasos sanguíneos: a primeira categoria é o tipo shunt direita-esquerda, também chamado de cardiopatia congénita cianótica, que é causada por anomalias estruturais no coração que fazem com que a pressão no coração direito exceda a do coração esquerdo, fazendo com que o sangue flua da direita para a esquerda ou uma origem anormal das grandes artérias, que Estes incluem a transposição aórtica e a tetralogia de Fallot. O segundo tipo é o tipo shunt da esquerda para a direita, que inclui defeito do septo atrial, defeito do septo ventricular ou do canal arterial patente. Em circunstâncias normais, o sangue é desviado da esquerda para a direita. Quando visto em condições de choro grave ou patológicas, podem também ocorrer desvios da direita para a esquerda quando a artéria pulmonar e a pressão ventricular direita devem exceder a do ventrículo esquerdo, pelo que este tipo é também chamado de doença cianótica precordial latente. O terceiro tipo é o tipo sem shunts, que se refere à ausência de vias ou shunts anormais entre os lados esquerdo e direito do coração ou entre as artérias e veias, tais como a constrição da aorta e a constrição da artéria pulmonar, etc. Este é o tipo sem shunts.