Depois de extrair o leite materno, recomenda-se que o deixe arrefecer e depois o congele, normalmente durante cerca de meia hora. Em geral, se produzir muito leite materno, pode extraí-lo primeiro e colocá-lo num recipiente de armazenamento de leite para o guardar, caso haja algum excedente para satisfazer as necessidades do seu bebé. Se precisar de congelar o leite materno, recomenda-se que espere que o leite arrefeça antes de o colocar no congelador. Isto porque colocar o leite materno no frigorífico quando a temperatura é demasiado elevada pode afetar ligeiramente a qualidade do leite materno e também o funcionamento do frigorífico. No entanto, se estiver com pressa, também pode colocá-lo diretamente no congelador. Além disso, se precisar de armazenar o leite materno extraído, deve selá-lo imediatamente para que não entre em contacto com microrganismos transportados pelo ar que possam afetar a sua qualidade. Normalmente, o leite materno armazenado congelado pode durar cerca de 1 semana e recomenda-se que seja consumido o mais cedo possível para evitar qualquer risco de segurança. Além disso, ao armazenar o leite materno, deve ter-se o cuidado de assegurar que os peitos estão limpos e higiénicos, e que o aparelho de ordenha e os produtos de armazenamento do leite estão devidamente limpos e esterilizados para evitar qualquer infeção do leite.