O fluconazol é normalmente utilizado em ginecologia para o tratamento de micose fungóide e os pacientes precisam de o tomar durante 3-5 dias ou, se a condição for grave, durante 3 meses. O fluconazol oral por si só é menos eficaz no tratamento de micose fungóide. As pacientes podem optar por usar tampões vaginais como o Dacronin ou o cloridrato de terbinafina efervescente vaginal juntamente com fluconazol oral, que deve ser administrado uma vez por dia à noite durante 1 semana e revisto após 3 dias de descontinuação. As reacções adversas GI comuns aos comprimidos de fluconazol oral incluem náuseas, vómitos, dores abdominais ou diarreia. Alguns doentes podem também experimentar tonturas, dores de cabeça ou reacções alérgicas, que podem requerer cuidados médicos rápidos se os sintomas forem graves. Além disso, os pacientes devem dormir o suficiente, manter uma boa higiene, comer uma dieta leve, principalmente rica em proteínas e pobre em gordura, e comer muita fruta e vegetais durante o tratamento.