O tratamento clínico da síndrome do compartimento intersticial utiliza geralmente os seguintes métodos: em primeiro lugar, para pacientes com doença ligeira, são utilizados enemas e descompressão gastrointestinal para reduzir a pressão intra-abdominal. Em segundo lugar, para casos mais graves, é geralmente necessário abrir o abdómen para descompressão, expor o tubo intestinal na cavidade abdominal fora do corpo, utilizar um saco esterilizado para embrulhar, e protegê-lo para prestar atenção aos bons cuidados após a operação. Depois o paciente necessita de reabastecimento intravenoso de fluidos corporais e nutrição adequada intravenosa até que o edema do intestino e outras condições melhorem e a pressão na cavidade abdominal se torne menor e a ferida seja novamente fechada cirurgicamente.