Nos doentes com gastroenterite, o primeiro passo é encontrar a causa da doença e também tratar os sintomas. É importante remover a causa, pois muitas vezes os pacientes com gastroenterite sofrem de vento e frio e de comer alimentos impuros. O tratamento sintomático deve também ter em conta os diferentes sintomas clínicos e a escolha de medicamentos. Para sintomas gastrointestinais superiores, tais como náuseas, vómitos e dores abdominais, o tratamento é frequentemente baseado em drogas como rabeprazol, alumínio-magnésio mais suspensão, Huo Xiang Zheng Qi cápsulas moles e Bao He Wan. Para pacientes com sintomas gastrointestinais inferiores, tais como diarreia, probióticos ou medicação antidiarreica, tais como montelukast, são frequentemente utilizados. Se o paciente tiver diarreia grave, especialmente fezes mucosas, pus e fezes de sangue, ou se o paciente não se conseguir livrar das fezes, é melhor ir ao hospital para consultar um médico e considerar se a diarreia é uma infecção bacteriana, e tomar medicação antibacteriana e re-hidratação.