A MSA é uma doença neurodegenerativa esporádica, com vários graus de disfunção autonómica, síndrome de Parkinson com uma fraca resposta à levodopa, ataxia cerebelar e fasciculações piramidais. As manifestações clínicas variam devido às diferentes sequências de envolvimento destes três sistemas no início da doença. Os três tipos são a síndrome de Shy-Drager (SDS), a degeneração striatonigral (SND) e a atrofia olivopontocerebelar (OPCA). As principais manifestações são: ataxia cerebelar, síndrome de Parkinson, e disfunção autonómica.