A infecção do citomegalovírus neonatal pode ser curada na fase aguda. Uma vez que a maioria dos citomegalovírus neonatais não é diagnosticada até a criança apresentar sintomas, a infecção por citomegalovírus neonatal está frequentemente associada a complicações tais como prematuridade, baixo peso à nascença, icterícia, hepatoesplenomegalia, e mesmo retardamento mental e trombocitopenia. Entre estes sintomas, a icterícia e a hepatoesplenomegalia são os sinais clínicos mais proeminentes. Após uma infecção do recém-nascido, é importante verificar prontamente se a criança tem infecção intra-uterina. Se a infecção por citomegalovírus for diagnosticada, a criança deve receber prontamente o ganciclovir, que tem um efeito anticitomegalovírus, durante cerca de seis semanas. Assim, a maioria das infecções por citomegalovírus em recém-nascidos são bem controladas e o prognóstico é melhor se baseado na ausência de complicações, deficiência hepática e renal, e retardamento mental.