A causa mais comum de gastrite atrófica é a infecção por Helicobacter pylori, uma bactéria que coloniza a mucosa gástrica e lhe causa danos persistentes. Alguns pacientes não estão conscientes destes danos ou não os detectam numa fase precoce, resultando no desenvolvimento gradual de vermelhidão, inchaço, erosão, hemorragia e mesmo atrofia e metaplasia da mucosa. Além disso, as causas que podem levar à gastrite atrófica estão mais relacionadas com a dieta. Por exemplo, em alguns pacientes, o consumo a longo prazo de alimentos oleosos, picantes, irritantes, frios ou dietas impuras, etc., pode induzir condições relacionadas com a erosão, atrofia e metaplasia da mucosa gástrica. Portanto, a dieta e as condições relacionadas com a H. pylori são as duas causas mais comuns de gastrite atrófica. Também precisa de ter cuidado para ajustar as suas emoções e não se stressar demasiado.