Não há nenhuma conclusão absoluta sobre quanto tempo se pode viver com gastrite atrófica, depende de uma série de factores como o grau de progressão e se a doença é complicada pelo cancro numa fase posterior. A gastrite atrófica tem uma certa tendência para se tornar cancerosa e, em geral, a probabilidade anual de a gastrite atrófica se tornar cancerosa situa-se entre 0,5% e 1%. Por conseguinte, os pacientes com gastrite atrófica devem ter a sua gastroscopia revista regularmente. A frequência da revisão da gastroscopia é determinada pelo facto de a hiperplasia epitelial intestinal ser ligeira, moderada ou grave, com base na gastroscopia e na patologia. No caso de hiperplasia atípica grave, a cirurgia pode ser recomendada; noutros casos, recomenda-se a revisão regular da gastroscopia e da patologia, que em alguns pacientes pode ter de ser feita uma vez de seis em seis meses a um ano, ou pelo menos uma vez de dois em dois anos. Se a gastrite atrófica crónica não for cancerosa e não ocorrerem perturbações graves do estômago, tais como hemorragias gastrointestinais, a maioria consegue sobreviver a longo prazo. Os pacientes com gastrite atrófica crónica não precisam de se preocupar demasiado. Com bons exames de seguimento, medicação regular e atenção à dieta sob a orientação de um médico, a maioria tem um bom prognóstico e é uma doença crónica que pode ser transportada durante muito tempo e não afecta necessariamente directamente a esperança de vida do paciente.