A febre aftosa afecta principalmente os animais de criação igualitária, tais como bovinos, ovinos e suínos, mas os seres humanos são menos susceptíveis à doença. A doença pode ocorrer nos seres humanos quando estes entram em contacto directo com as secreções ou excreções de animais doentes, ou quando ingerem alimentos ou água contaminados por animais doentes ou inalam pó contendo vírus através de gotículas transportadas pelo ar. O vírus também pode ser excretado em seres humanos, mas é largamente não contagioso de pessoa para pessoa.