Não há tratamento específico para a febre aftosa e o tratamento sintomático é a base da doença. Os doentes são internados no hospital para isolamento e observação, e recebem tratamentos tais como arrefecimento e limpeza bucal para prevenir infecções secundárias. Os sintomas da doença são ligeiros e a maioria dos doentes recupera espontaneamente sem cicatrizes locais. No entanto, têm sido notificadas mortes em casos graves.