As causas do refluxo ácido incluem o seguinte: Em primeiro lugar, maus hábitos alimentares, a ingestão de grandes quantidades de substâncias ácidas que tendem a causar uma secreção excessiva de ácido estomacal, ou exercício insuficiente para promover a peristaltismo após a ingestão, ou mesmo deitar-se imediatamente, pode causar o refluxo do conteúdo estomacal e do ácido para o esófago. Segundo, a presença de doenças do tracto digestivo, incluindo esofagite e gastrite crónica, úlcera duodenal, úlcera gástrica, etc., estas lesões são susceptíveis de causar o fenómeno de refluxo do ácido estomacal. A má digestão e o lento peristaltismo gastrointestinal podem causar uma grande quantidade de alimentos que não se decompõem completamente e que os alimentos permanecem no estômago e nos intestinos durante muito tempo, causando assim facilmente o refluxo ácido.