A conjuntivite aguda em crianças não é muito diferente da conjuntivite aguda em adultos. O curso da conjuntivite aguda é normalmente de 7-14 dias e desenvolve-se normalmente em ambos os olhos simultaneamente ou sequencialmente, com o início sequencial a ocorrer normalmente com cerca de 1-2 dias de intervalo. A doença progride para o seu pico 3-4 dias após a infecção por conjuntivite aguda e depois diminui e melhora gradualmente ou cura após 7-14 dias. Se uma criança tem conjuntivite aguda, deve ser vista activamente no hospital. Também se deve ter o cuidado de evitar que a criança afectada esfregue os seus olhos com as mãos para evitar a propagação da doença a outras crianças. Quando sofrer de conjuntivite aguda, deve ter-se o cuidado de isolar a criança durante o período de infecção aguda.