Os pacientes com abcessos perianais não podem ser curados completamente por aspiração, o que é apenas uma forma de obter um diagnóstico. O tratamento mais eficaz para os abcessos perianais é a incisão e drenagem do pus, e a difamação e cultura do pus para o tratamento anti-infeccioso direccionado. Ao mesmo tempo, a cavidade de abscesso deve ser minuciosamente explorada e a abertura interna encontrada para evitar a formação de uma fístula pós-operatória, uma vez que os abcessos perianais são na maioria das vezes o resultado de inflamação recorrente do seio anal, pelo que deve ser feita uma incisão da abertura interna, se necessário, ou deve ser pendurado um fio. É importante mudar a medicação regularmente após a cirurgia para promover a cura e evitar deixar cavidades residuais em cada mudança para evitar a formação de fístulas pós-operatórias.