Uma causa comum é a estomatite herpética primária causada pelo vírus do herpes simplex, que é mais comum em crianças com menos de 6 anos de idade, especialmente mais frequentemente entre os 6 meses e os 2 anos de idade, e a maioria pode curar espontaneamente mantendo a boca limpa e evitando alimentos irritantes; o prognóstico é geralmente bom com terapia antiviral sistémica, medicação tópica, gestão sintomática e terapia de apoio, se necessário.
Além disso, em crianças com um ligamento lingual curto, se as arestas afiadas dos incisivos recentemente erupcionados roçarem contra o ligamento lingual curto durante um longo período de tempo, o ligamento lingual fica congestionado, inchado e forma uma úlcera. É necessária uma mudança no estilo de alimentação da criança de biberão para alimentação à colher, correcção cirúrgica do laço lingual curto e afiação do bordo demasiado afiado.