Para além dos efeitos secundários sobre o tracto gastrointestinal e rins, os AINE podem ter alguns efeitos secundários sobre outros órgãos electricamente. Alguns AINE podem produzir efeitos secundários neurológicos leves, com sintomas comuns como dores de cabeça; tonturas, tinnitus, insónia e sensações anormais. Em casos de intoxicação, podem ocorrer sintomas graves como delírios, convulsões e coma. Os AINEs também têm certos efeitos no sistema hematológico, sendo a granulocitopenia e a anemia aplástica as mais comuns. Doses mais elevadas de preparações de ácido salicílico podem inibir a aglutinação plaquetária e reduzir a sua capacidade de aderir umas às outras, prolongando assim o tempo de hemorragia. A hemorragia grave pode frequentemente ser induzida na presença de lesões vasculares coexistentes, especialmente naquelas com lesões cerebrovasculares. Os AINE devem ser reduzidos para prevenir a hemorragia quando a anticoagulação é utilizada em doentes com válvulas cardíacas artificiais ou embolia vascular. Os salicilatos devem ser utilizados com precaução em doentes com danos hepáticos, deficiências vitamínicas e pré-cirúrgicos. AINEs como aspirina e anti-inflamatórios podem causar danos hepáticos, com sintomas comuns como xantogranuloma, transaminases elevadas, náuseas e vómitos. Além disso, erupções cutâneas e reacções alérgicas não são incomuns, e reacções alérgicas graves podem mesmo levar à asma e ao choque. Nestes casos, deve ser levado rapidamente para o hospital.