Hirudin pode tratar coágulos de sangue, mas o seu mecanismo de acção não é dissolver o coágulo, mas sim inibir a sua formação. A formação de trombos é principalmente causada por uma série de alterações complexas após hidrólise de proteínas por trombina, o que acaba por causar coagulação e trombose.
A hirudina, no entanto, é um ingrediente anticoagulante eficaz derivado da sanguessuga da medicina herbal chinesa, que inactiva a actividade da trombina e, portanto, tem um forte efeito anticoagulante, inibindo assim a formação de trombos. Pertence ao uso clínico como coadjuvante da terapia trombolítica para o enfarte agudo do miocárdio, e também pode ser utilizado para a prevenção e tratamento de doenças trombóticas arteriais e venosas, coagulação intravascular difusa, anticoagulação em hemodiálise, etc. É geralmente administrada por via intravenosa, e a hirudina geneticamente recombinante é agora mais comummente utilizada na prática clínica.