As diferentes fases da trombose venosa são tratadas de forma diferente, mas, em geral, são necessários fármacos anticoagulantes para tratar a doença, e os fármacos orais normalmente utilizados e eficazes são geralmente a varfarina para o tratamento anticoagulante. Na fase inicial da TVP, os pacientes podem ser tratados com drogas, como heparina sódica intravenosa, drogas orais são geralmente varfarina para anticoagulação e drogas trombolíticas, como uroquinase, estreptoquinase, etc. Se o efeito da anticoagulação da droga não for bom, o paciente pode ser tratado com drogas orais. Se o efeito da anticoagulação medicamentosa não for satisfatório, pode ser efectuada uma terapia trombolítica de intervenção ou uma terapia trombolítica cirúrgica para evitar a ocorrência de complicações. Os doentes com trombose venosa superficial apresentam geralmente um pequeno inchaço localizado dos tecidos moles, que normalmente não necessita de medicação oral, e é geralmente tratado com medicação tópica localizada e retirada dos estímulos. Os doentes com trombose venosa devem procurar assistência médica o mais rapidamente possível, e o médico deve escolher o tratamento adequado de acordo com o estado do doente, devendo a medicação ser aplicada sob a orientação do médico.