A principal diferença entre a miastenia gravis e a polimiosite é a localização das lesões. A miastenia gravis é uma doença da junção neuromuscular e o principal local de lesão nos doentes é o dos receptores de acetilcolina na membrana pós-sináptica da junção neuromuscular, que são atacados devido à inflamação auto-imune presente nos doentes. Os sintomas clínicos são fraqueza muscular esquelética generalizada ou parcial, caracterizada por fadiga patológica fácil, leve de manhã e pesada à noite, piorando com a actividade e diminuindo com o repouso, e eficaz com a terapia inibidora da colinesterase. A polimiosite é uma doença muscular, também essencialmente uma doença inflamatória imunitária, que é uma inflamação difusa do músculo esquelético causada por múltiplas causas. Os doentes apresentam principalmente fraqueza muscular aguda ou subaguda nas extremidades proximais, frequentemente acompanhada de dores de pressão. As análises ao sangue podem revelar um perfil sérico significativamente elevado das enzimas musculares e a electromiografia sugere danos miogénicos.