Não há nenhum termo clínico para o primeiro dia de amigdalite que seja grave. O período em que a tonsilite é mais grave está relacionado com a constituição do paciente individual e com a presença ou ausência de tratamento activo. Em geral, os sintomas são mais graves no segundo a quinto dia, com uma febre alta de 39-40°C, bem como vómitos e letargia. Na fase inicial da amigdalite, pode manifestar-se apenas como desconforto na garganta. À medida que a doença progride, a inflamação piora gradualmente, e a febre, dor de garganta, e em casos graves, pode ocorrer infecção em torno das amígdalas, dificuldades de deglutição e de respiração. Para pacientes que apenas apresentam desconforto faríngeo, podem ser curados por auto-imunidade sem medicação; para pacientes que apresentam outros sintomas, o factor de infecção precisa de ser clarificado por amostragem de sangue. Para infecções bacterianas, antibióticos de largo espectro como a penicilina e a cefalosporina podem ser usados para tratamento; para infecções virais, medicamentos antivirais como o busulfan e o diflucan podem ser usados para tratamento, e pacientes com tosse e expectoração precisam de ser tratados sintomaticamente com nebulização local e xarope para a tosse. Quando as amígdalas estão inflamadas, é importante prestar atenção à abertura regular de janelas para manter o ar fresco. Quando o ar estiver seco, é possível manter o ar a um certo nível de humidade utilizando um humidificador, comendo levemente e bebendo mais água quente para reduzir a estimulação da faringe. Os pacientes no período febris suarão muito quando a febre for reduzida, pelo que necessitam de mudar a roupa interior a tempo. A amigdalite é contagiosa, pelo que se recomenda a desinfecção da roupa usada do paciente, pratos e outros artigos domésticos para evitar infectar os outros.