Quando um abcesso perianal não é supurante nas fases iniciais, pode optar por tomar antibióticos de largo espectro como a cefalosporina, penicilina e levofloxacina. Contudo, o abcesso perianal é uma doença que só pode ser curada por cirurgia. Geralmente, os antibióticos orais e IV não são particularmente eficazes, e a maioria dos pacientes na prática clínica tomam medicamentos anti-inflamatórios orais e IV e depois submetem-se a cirurgia, por isso, se as condições o permitirem, recomenda-se a cirurgia o mais cedo possível. Como o abcesso perianal é uma doença infecciosa e desenvolve-se relativamente depressa, é infectado devido à presença de uma abertura interna primária e à entrada de bactérias patogénicas que provocam a supuração do tecido local. Assim, se as condições o permitirem, recomenda-se a cirurgia o mais cedo possível.