A tiroidite subaguda não é geralmente uma vacina durante o início da doença, o que pode agravar a doença e pode também causar reacções adversas. Durante o início da tiroidite subaguda, os doentes apresentam frequentemente sintomas desconfortáveis, como febre e dores no pescoço. A vacinação nesta situação pode levar a um maior agravamento dos sintomas clínicos, o que não é propício à recuperação da doença. Quando os doentes na fase aguda da tiroidite subaguda estão a ser tratados, precisam de aplicar medicamentos terapêuticos relevantes, como antipiréticos e analgésicos e glucocorticóides. A administração da vacina pode provocar uma reação entre a medicação utilizada para tratar a tiroidite e a medicação utilizada na vacina. Por conseguinte, os doentes com tiroidite subaguda devem tentar evitar a vacinação durante o início da doença, através de tratamento sintomático ativo, quando a condição estiver gradualmente estabilizada, pode consultar o médico em pormenor sobre o momento adequado para a vacinação.