A fase II está dividida em fases IIA e IIB, dependendo de onde o cancro se tenha espalhado. Na fase IIA, o cancro alastrou (1) para a camada muscular ou a camada do tecido conjuntivo da parede do esófago, e as células cancerosas são de grau 1. As células cancerígenas de grau 1 parecem mais células normais sob um microscópio e crescem e propagam-se mais lentamente do que as células cancerígenas de grau 2 e 3. O tumor encontra-se no esófago superior ou médio; ou (2) na camada muscular ou na camada do tecido conjuntivo da parede do esófago, e as células cancerígenas são de grau 2 e 3. As células cancerígenas de grau 2 e 3 parecem mais anormais sob um microscópio e crescem e propagam-se mais rapidamente do que as células cancerígenas de grau 1. O tumor encontra-se no esófago inferior ou não se sabe onde o tumor se encontra.