A fenda labial congénita é causada por uma série de factores que afectam o feto durante o seu desenvolvimento. Em particular, durante as primeiras 12 semanas de desenvolvimento fetal, podem ocorrer várias malformações correspondentes devido aos efeitos, sendo o lábio leporino fendido um dos mais comuns. Há muitos factores que contribuem para a ocorrência de lábio leporino fendido, incluindo genética, nutrição, infecção, lesão ou os efeitos da medicação. A causa exacta não é bem compreendida e pode ser o resultado de um ou mais destes factores actuando ao mesmo tempo, pelo que é importante tomar medidas preventivas proactivas nas fases iniciais da gravidez. É muito importante evitar a ocorrência de lábio leporino fendido. As futuras mães que se estão a preparar para a gravidez devem ser educadas sobre o assunto e devem prestar atenção à distribuição adequada de nutrientes. Durante a gravidez, é importante evitar o stress excessivo e o stress emocional e manter um humor feliz. Não fumar nem beber álcool e tentar evitar infecções virais. Em caso de doença, os medicamentos que possam causar malformações no feto devem ser proibidos.