O factor patológico mais comum que causa o odor do umbigo é principalmente a umbilicite, seguida de eczema ou erupção cutânea da fossa umbilical, doenças ureterais umbilicais congénitas, tais como ureter umbilical não fechado, cistos e fístulas. Alergias, lesões cutâneas, inflamação e escorrimento podem também levar ao odor devido a diferenças corporais ou ao uso impróprio de manchas no umbigo.