As crianças podem ser diagnosticadas com úlceras orais traumáticas através de uma combinação de história de doença, história de trauma oral, sintomas clínicos, exame físico e exame patológico. As úlceras orais traumáticas são mais difíceis de diagnosticar mas têm menos significado diagnóstico, e os sintomas diminuem geralmente rapidamente após a remoção da lesão persistente.
Por conseguinte, o diagnóstico de úlceras orais traumáticas envolve geralmente um processo de exame físico, tratamento etiológico e exame patológico em três etapas.
O diagnóstico de úlceras orais traumáticas é feito identificando primeiro se o paciente teve episódios recorrentes de sintomas semelhantes, perguntando depois se o paciente foi submetido a cirurgia aos dentes ou à mucosa oral, e se o paciente consumiu alimentos irritantes ou medicamentos de natureza desconhecida. Se estes estiverem presentes, é realizado um exame intra-oral para procurar irritantes físicos e químicos persistentes e removê-los, ou seja, tratar a causa. Se os sintomas não se resolverem, deve ser realizada uma patologia adicional para identificar a causa.