A criptorquidia pediátrica tem uma certa predisposição genética, sendo que uma história familiar de criptorquidia resulta numa prevalência de cerca de 15% na descendência. A criptorquidia é uma doença congénita com uma predisposição genética relativamente clara e o desenvolvimento da criptorquidia está relacionado com os próprios testículos e com factores endócrinos. A criptorquidia ocorre principalmente em bebés prematuros, com baixo peso à nascença e do sexo masculino com antecedentes familiares de criptorquidia. Os fetos nascidos de mães com maus hábitos durante a gravidez, como fumar, beber e consumir drogas, também são propensos à criptorquidia. Atualmente, a incidência de criptorquidia está a aumentar de ano para ano e é uma das principais causas de infertilidade masculina. A maioria das crianças com criptorquidia é unilateral e algumas criptorquidias são bilaterais.