As doenças causadas por casamentos consanguíneos podem ser hereditárias. Os casamentos consanguíneos aumentam, em primeiro lugar, as hipóteses de doenças de herança recessiva. Biologicamente, os seres humanos têm dois conjuntos de cromossomas das linhas paterna e materna, e as doenças genéticas recessivas são aquelas que se desenvolvem quando os loci correspondentes em ambos os conjuntos de cromossomas têm o mesmo gene causador da doença. As pessoas em casamentos consanguíneos têm um maior grau de semelhança cromossómica porque partilham um antepassado comum. No caso de doenças herdadas recessivamente, existe uma possibilidade concreta de os seus filhos e descendentes se tornarem de sangue puro e, por conseguinte, apresentarem a doença. Esta é a principal causa de morbilidade na descendência. Devido à elevada probabilidade de doenças hereditárias na descendência em resultado de casamentos consanguíneos, o Estado proíbe os casamentos entre parentes consanguíneos em linha direta e parentes consanguíneos colaterais até três gerações.