O peróxido de hidrogénio não é usado rotineiramente para tratar condições inflamatórias do ouvido médio. Se um paciente tem uma condição aguda de otite média, que é simplesmente um estado de congestão aguda e inchaço do tímpano, e não há descarga inflamatória ou purulenta óbvia do canal auditivo, o peróxido de hidrogénio não é normalmente necessário. Se o paciente tiver uma grande acumulação de secreções inflamatórias purulentas no canal auditivo, ou mesmo na cavidade do ouvido médio, que são difíceis de remover suave ou completamente, podem ser usadas gotas de peróxido de hidrogénio neste caso para proporcionar um efeito de diluição suficiente para facilitar a remoção posterior destas secreções inflamatórias utilizando um aspirador, e para manter uma drenagem clara do canal auditivo e da cavidade do ouvido médio. As gotas de peróxido de hidrogénio são utilizadas apenas como coadjuvante na limpeza do canal auditivo e não como tratamento de rotina para as otites médias.