A diarreia em bebés precisa de ser tratada de acordo com a sua causa, por isso a escolha do medicamento também precisa de se basear na causa. Se a diarreia for devida a uma infecção, recomenda-se o tratamento anti-bacteriano e anti-viral, e podem ser administrados medicamentos anti-bacterianos e anti-virais, conforme o caso. Para a diarreia não infecciosa, pode-se tomar montelukast, que tem um efeito adstringente para parar a diarreia. Também se pode adicionar ervas chinesas para fortalecer o baço e o estômago, conforme apropriado, sob a orientação do médico para ajudar na recuperação da diarreia. Além disso, também pode tentar suplementar o seu bebé com probióticos, incluindo Bifidobacterium bifidum e Lactobacillus preparados de bactérias vivas, tais como Mamia, que são adequados para a diarreia, obstipação e inchaço causados por indigestão, perda de apetite, desnutrição e distúrbios da flora intestinal. Se a bifidobactéria não estiver a funcionar bem, também se pode tomar Bactérias Quádruplas, o que é mais eficaz para equilibrar o ambiente microbiológico do intestino. Além disso, é também necessário excluir se a diarreia do seu bebé é devida à intolerância à lactose. Se um bebé alimentado com uma fórmula for intolerante à lactose, mudar para uma fórmula sem lactose. Tenha também o cuidado de manter o seu bebé hidratado com sal para evitar a desidratação. Tenha o cuidado de dar ao seu bebé comida fresca, não restos de comida da noite para o dia, e não coma alimentos estimulantes frios e picantes para evitar náuseas, vómitos, inchaço, diarreia, dor abdominal e outros desconfortos que possam afectar o crescimento e desenvolvimento normal do seu bebé.