A toma de medicação anti-esquizofrénica não é normalmente prejudicial para o cérebro, desde que seja supervisionada por um médico. No entanto, os próprios medicamentos têm um certo efeito inibidor neurológico e podem apresentar um declínio da função neurológica durante a sua toma, mas isso não é sinal de lesão cerebral. Os medicamentos contra a esquizofrenia baseiam-se geralmente em antipsicóticos de segunda geração, como a olanzapina, a quetiapina, etc. Estes medicamentos foram confirmados pela prática clínica e nenhum deles apresenta lesões cerebrais. A sonolência e o declínio intelectual que ocorrem durante a administração do medicamento devem-se principalmente à inibição da função nervosa pelos medicamentos, que inibem principalmente a atividade dos receptores sinápticos e colocam o cérebro e o sistema nervoso relacionado num estado de hipoatividade, controlando assim a esquizofrenia e ajudando o doente a recuperar, e não é uma manifestação de danos no cérebro. Geralmente, depois de a doença estar controlada e a medicação ser gradualmente reduzida sob a orientação do médico, a função cerebral voltará ao normal, pelo que não há necessidade de preocupação excessiva, desde que a medicação seja tomada sob a orientação do médico. No entanto, deve ter-se em atenção que a utilização destes medicamentos deve ser efectuada sob a orientação de um médico, e deve ser feita estritamente de acordo com as instruções do médico, com uma dosagem regular, não podendo aumentar ou diminuir a quantidade de medicação sem autorização.