As doenças pulmonares causadas por infecções bacterianas que não são tratadas eficazmente ou com medicação inadequada podem levar a mudanças no estado do paciente e até mesmo a exacerbações, frequentemente manifestadas visualmente por um aumento dos sintomas respiratórios. Por exemplo, os pacientes podem experimentar tosse aumentada, aumento da expectoração e, em alguns casos, febre e mesmo dificuldade em respirar. Por conseguinte, é importante verificar a presença de bactérias patogénicas neste grupo de pacientes. Normalmente, a expectoração pode ser tomada para esfregaço bacteriano geral e cultura antes de ser administrada uma anti-infecção eficaz. Antes disso, os antibióticos devem ser administrados empiricamente de acordo com o desempenho do paciente e depois ajustados de acordo com os resultados da sensibilidade do medicamento para evitar o agravamento do estado do paciente.