Os principais fármacos utilizados no tratamento das sequelas da trombose cerebral são os antiagregantes plaquetários, os estabilizadores de placas e os fármacos que melhoram o metabolismo das células cerebrais. A principal causa de trombose cerebral nos idosos é a aterosclerose e os fármacos antiagregantes plaquetários e estabilizadores da placa são os principais fármacos para tratar a aterosclerose e prevenir a recorrência da trombose cerebral. Os fármacos anti-agregantes plaquetários mais utilizados são a aspirina, o clopidogrel, etc., e os fármacos estabilizadores da placa são a atorvastatina, a resuvastatina, etc. Para além de melhorar o metabolismo das células cerebrais, o medicamento tem de promover a recuperação dos sintomas de défice neurológico, podendo os doentes com sequelas de trombose cerebral tomá-las. Os medicamentos habitualmente utilizados são o hidrolisado de proteínas cerebrais, o piracetam, etc. Para os doentes com sequelas de trombose cerebral, recomenda-se que consultem o neurologista, sob a orientação do médico, para que a medicação seja normalizada e não se automediquem às cegas.