A via mais importante de transmissão da cólera é através da água, e a transmissão da água desempenha um papel importante na cólera, especialmente em locais com saneamento deficiente, onde os rios, lagoas, lagos e poços são altamente susceptíveis à contaminação. As pessoas nas zonas rurais têm o hábito de beber água crua, lavar a boca com água crua, lavar utensílios de alimentação e mergulhar frutas e vegetais durante os meses de Verão, e estes hábitos aumentam as probabilidades de transmissão de cólera através da água. A transmissão através da água pode ocorrer em pandemias violentas, onde os doentes tendem a ser distribuídos ao longo de fontes de água contaminadas e as concentrações de cólera podem ser medidas em corpos de água. As epidemias podem ocorrer em áreas com elevada imunidade à população, enquanto que os surtos podem ocorrer em áreas com baixa imunidade.