As principais fontes de infecção por leptospirose são ratos e porcos, dos quais o rato cigano de fio preto é a principal fonte de infecção por leptospirose do tipo arroz. A leptospirose na sua urina é descarregada para os arrozais e os agricultores são susceptíveis de infecção aquando da colheita do arroz. Os porcos também contêm grandes números de leptospirose na sua urina devido ao seu contacto próximo com os seres humanos, e têm um longo período de eliminação, pelo que podem contaminar fontes de água, e os currais são húmidos e aquosos, com grandes números de leptospirose presentes na lama e na água parada. Os doentes com leptospirose também podem excretar bactérias na sua urina, mas como a urina humana é ácida, não é adequada para o crescimento da leptospirose. Também é possível que as infecções latentes sejam excretadas, mas a taxa de excreção não é elevada e, portanto, é pouco provável que os seres humanos sejam uma fonte de infecção.