Há vários efeitos secundários que precisa de ter cuidado sozinho após tomar o medicamento e precisa de procurar cuidados médicos assim que o desconforto ocorrer.
Deficiência de granulócitos: Quando a deficiência de granulócitos ocorre, a imunidade do corpo é extremamente baixa e é susceptível a várias doenças. Por conseguinte, ao tomar medicação anti-tiróide, para além de controlos regulares da contagem de leucócitos no sangue periférico, os doentes precisam de ser monitorizados quanto a sintomas clínicos de febre e dor de garganta.
Doença hepática tóxica: Num pequeno número de doentes, podem ocorrer anomalias na função hepática, pelo que é necessária uma revisão regular da função hepática.
Erupção: é uma reacção alérgica e precisa de ser observada no hospital se não se resolver por si só.