Os pacientes com dores de estômago podem ser tratados com omeprazol, sendo frequentemente a primeira escolha de medicação. Se for alérgico ao omeprazol, não deve tomar omeprazol. Se tiver outros problemas de saúde específicos, tais como doenças cardíacas, não deve tomar omeprazol e deve consultar um especialista para outros supressores ácidos. A maioria das dores de estômago são causadas por doenças do estômago e são geralmente devidas à secreção excessiva de ácido estomacal. O omeprazol é um representante dos inibidores da bomba de prótons e tem um forte efeito supressor de ácido. Evidentemente, a eficácia do tratamento varia de pessoa para pessoa, nem todas as pessoas que tomam omeprazol são muito eficazes, e pode ser necessário mudar para outros inibidores da bomba de prótons, tais como o esomeprazol.