Os doentes com doenças cardíacas congénitas podem ter o coração transplantado. Os transplantes cardíacos são geralmente realizados em doentes com doenças cardíacas congénitas em fase terminal que não podem ser curados por vários métodos, incluindo procedimentos cirúrgicos e intervencionais, e que têm uma esperança de vida não superior a seis meses ou um ano. Em contraste, a maioria dos pacientes com doenças cardíacas congénitas pode alcançar um resultado muito satisfatório com um tratamento cirúrgico aberto. Para tipos complexos de doenças cardíacas congénitas, o transplante cardíaco é também bastante eficaz quando o tratamento cirúrgico convencional falhou. Actualmente, os transplantes de coração para doenças cardíacas congénitas no nosso país são frequentemente realizados em crianças, bebés ou crianças, porque as doenças cardíacas congénitas são menos reactivas e menos medicadas após o transplante de coração, e os resultados são melhores do que nos adultos. No entanto, uma das maiores incertezas para as crianças após o transplante cardíaco é a fraca adesão das crianças e dos pais à medicação de acompanhamento. Algumas pessoas sentem que tudo está bem após a cirurgia e que não precisam de tomar medicamentos, pelo que param, o que pode levar à rejeição e mesmo à morte. Os sucessos são abundantes, mas os fracassos também são muito dolorosos quando ocorrem. Se seguir os requisitos rigorosos do médico para revisão, a cirurgia deve dar melhores resultados do que em adultos.