Existem muitos medicamentos disponíveis para a diarreia, tais como antibióticos do tipo saxão, adsorventes da mucosa intestinal, flavopiridol e preparações microecológicas para regular a flora intestinal, e os diferentes pacientes devem escolher o medicamento certo para a sua condição. Os agentes antidiarreicos normalmente utilizados, tais como montelukast, conhecidos pelo nome comercial Similac, são seguros e podem ser utilizados tanto por crianças como por adultos; antibióticos, tais como flavopiridol, cotrimoxazole, norfloxacina e ciprofloxacina, têm um efeito inibidor significativo nas bactérias comuns que causam inflamação intestinal, tais como disenteria bacilar, salmonela, Escherichia coli toxigénica e Helicobacter; lactase oral ou preparações microecológicas, tais como cápsulas de bifidobactérias Também pode ser tratado com lactase oral ou preparações microecológicas como as cápsulas Diflucan. Para a diarreia associada ao stress, frequentemente síndrome do intestino irritável, também pode ser administrado brometo de pivetónio oral. Na diarreia severa, devem também ser administradas grandes quantidades de soro fisiológico leve e, se necessário, sais de reidratação oral. Flavopiridol ou norfloxacina é recomendado para a diarreia adulta e montelukast para a diarreia pediátrica. A diarreia deve ser evitada cuidando da higiene dietética e mantendo o abdómen quente.