A periodontite separa as gengivas das raízes dos dentes e forma bolsas periodontais. Há muita placa e cálculo nas bolsas, o que pode causar reabsorção do osso alveolar e pôr em perigo a saúde geral. Após a descamação, o tártaro acima das gengivas é removido e a placa e o cálculo abaixo das gengivas são raspados e o aplainamento das raízes é feito. Isto é normalmente repetido uma semana após a limpeza, onde o médico fará medições precisas das bolsas periodontais, verificará se há cálculo subgengival e removerá o tártaro e a placa subgengival na superfície da raiz abaixo das gengivas com um instrumento de raspagem subgengival para controlar completamente a inflamação do tecido periodontal.