Os sintomas de todos os tipos de amigdalite são semelhantes. No caso de amigdalite aguda, os sintomas sistémicos são mais graves e podem incluir arrepios, febre alta, dores de cabeça, perda de apetite, fadiga, mal-estar geral, obstipação, etc. Algumas crianças podem ter convulsões, vómitos, ou mesmo letargia devido à febre alta. Os sintomas locais de amigdalite aguda são principalmente dor de garganta, e quando a dor é grave, pode irradiar para os ouvidos, e até piorar ao engolir, e alguns são acompanhados por gânglios linfáticos aumentados no pescoço.
A amigdalite crónica é principalmente caracterizada por dor de garganta crónica, mas também pode ser caracterizada por secura na faringe, comichão na garganta, sensação de corpo estranho, e até tosse irritante. Se houver retenção de secreção na fossa amigdalar, pode até haver sintomas de mau hálito. Em crianças com inflamação recorrente e aumento excessivo das amígdalas, podem ocorrer sintomas tais como respiração fraca, ronco durante o sono, deglutição ou distúrbios de ressonância da fala.