Focos de calcificação intra-hepática podem encobrir tecido necrótico ou danificado e promover a sua recuperação, pelo que os factores que causam danos no fígado podem causar focos de calcificação intra-hepática.
Factores de doença: por exemplo, hepatite, tuberculose hepática, abcesso hepático, encapsulação hepática, esquistossomose hepática, cancro hepático, hemangioma hepático, tumores metastáticos hepáticos, etc.
Factores de medicação: uso frequente de contraceptivos orais, ou uso de estrogénio e progestina, imunossupressores e outros medicamentos para tratar doenças.
Factores ambientais: viver em áreas de água infectadas ou contacto frequente e próximo com pessoas que sofrem de doenças infecciosas do fígado.
Factores dietéticos: falta de higiene alimentar, consumo de alimentos bolorentos, preferência por alimentos gordurosos e com elevado teor de gordura, etc.
Factores pessoais: displasia congénita, perturbações do metabolismo do cálcio e do fósforo, tabagismo, alcoolismo, etc.