O tratamento da faringite folicular é principalmente etiológico e sintomático.
O tratamento etiológico é o principal tratamento para a faringite folicular e inclui: tratamento activo da faringite aguda, rinite, sinusite ou outras doenças que desencadeiam a faringite folicular; cessação do tabagismo e do álcool, evitar a exposição ao pó, gases nocivos, dietas picantes e estimulantes, etc.; e melhoria do exercício físico para fortalecer a própria constituição.
O tratamento sintomático inclui ablação a laser, electrocoagulação ou criocirurgia para tratar folículos linfáticos na parede faríngea posterior, e comprimidos faríngeos orais para alívio da dor e tratamento anti-inflamatório.