O eczema pediátrico é causado por uma série de factores, tanto externos como genéticos.
Os factores extrínsecos incluem o ambiente, o clima húmido e a exposição solar; artigos domésticos quotidianos, tais como fibras químicas, tecidos de lã e produtos químicos.
Os factores genéticos estão também associados ao desenvolvimento do eczema pediátrico.
A pele pediátrica é normalmente fina, com anormalidades na sua estrutura de estrato córneo, conteúdo reduzido de água na pele e conteúdo reduzido de sebo, resultando numa protecção reduzida da pele e susceptibilidade a estímulos externos que podem levar ao eczema.