A maioria das fístulas anais são causadas por abcessos perirectais, que se podem formar se o abcesso se decompuser sozinho ou se o abcesso for incisado e drenar para uma abertura externa. À medida que as feridas externas crescem e cicatrizam mais rapidamente, as fístulas muitas vezes pseudo-cura, levando a rupturas recorrentes do abscesso e à formação de múltiplas aberturas externas, tornando as fístulas anais simples complexas.